工藤(téng )新一是全国(guó )著名(míng )的高中(zhōng )生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了(le )防(fáng )止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得(dé )到(dào )解药。一(yī )日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿(ā )笠博士的家寻(xún )找男友的(de )下落，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了自(zì )己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名(míng )私家侦探，新一(yī )可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生(shēng )，他们(men )一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战(zhàn )！