工藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时(shí )不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇(qí )的药水，工(gōng )藤新(xīn )一(yī )变回了(le )小孩(hái )！新一找到(dào )了经常帮(bāng )助(zhù )他(tā )的(de )阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报(bào )复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新(xīn )一 的(de )女友毛利兰来到(dào )了(le )阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造(zào )了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办案一(yī )起追查(chá )黑夜人的(de )下落。柯南(nán )在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣(xuān )战！