工藤新一(yī )是全国著名的(de )高中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙(huǒ )成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进(jìn )行(háng )报(bào )复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰(lán )撞见的新一(yī )情急之下编造了自己名(míng )叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲(qīn )毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南在小学(xué )认识步美(měi )等小学生，他(tā )们一(yī )起(qǐ )组织了一个少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战！