工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成(chéng )员发现(xiàn )，击晕后(hòu )喂了神奇(qí )的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士(shì )为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武(wǔ )器。为了(le )防止(zhǐ )犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的(de )女友毛(máo )利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探(tàn )，新一可以籍(jí )着和他(tā )一起四(sì )出办案一起追查(chá )黑夜人的(de )下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生(shēng )，他们(men )一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯(fàn )宣战！