工(gōng )藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回(huí )了(le )小孩！新一找到了(le )经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛(máo )利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下(xià )落，被(bèi )小兰(lán )撞见的新一情急之下(xià )编造了自己名(míng )叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一(yī )名私家(jiā )侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出(chū )办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等(děng )小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！