工藤(téng )新一是(shì )全国著名的高中(zhōng )生侦(zhēn )探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸(xìng )被(bèi )团伙(huǒ )成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他(tā )进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希(xī )望(wàng )能得(dé )到解药。一(yī )日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友(yǒu )的下落(luò )，被小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新(xīn )一情急之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起四出(chū )办案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生(shēng )，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！