工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击(jī )晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一(yī )变回(huí )了小孩(hái )！新一找到(dào )了(le )经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器(qì )。为了(le )防止犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希(xī )望能得到解药(yào )。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一情(qíng )急(jí )之下编造了自己(jǐ )名(míng )叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎(láng )是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出(chū )办案一(yī )起追查(chá )黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等小学生，他(tā )们(men )一起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！