工藤新(xīn )一是全国著(zhe )名的(de )高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮(bāng )助(zhù )他的阿(ā )笠博士(shì )，博(bó )士为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定(dìng )隐姓(xìng )埋名，暗中(zhōng )追(zhuī )查(chá )他们，希望能得到(dào )解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新一情急之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯(kē )南寄(jì )居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利(lì )小五(wǔ )郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！