工(gōng )藤(téng )新一(yī )是(shì )全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇(qí )的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠(lì )博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复(fù )，新一(yī )决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一 的(de )女(nǚ )友毛(máo )利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编(biān )造了自己名(míng )叫江户(hù )川柯(kē )南，随后柯南寄居在了(le )小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以(yǐ )籍着和他一(yī )起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！