工藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙(huǒ )成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为(wéi )他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名(míng )，暗(àn )中追查他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情(qíng )急之下编造了自(zì )己名叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛(máo )利小五郎(láng )是一(yī )名私家侦探(tàn )，新一可以籍(jí )着和他一起四出(chū )办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等(děng )小学生，他们一起(qǐ )组织了(le )一个少年侦探团，向(xiàng )罪(zuì )犯宣(xuān )战！