工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了神奇(qí )的(de )药水，工藤新一(yī )变回了小孩(hái )！新(xīn )一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他度(dù )身打造不少间谍(dié )武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希(xī )望能(néng )得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰(lán )撞见的新一情急(jí )之(zhī )下编造了自己名叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一(yī )起四出(chū )办(bàn )案一起追查(chá )黑夜人的(de )下落。柯南在小学认识步美(měi )等(děng )小学生，他们一(yī )起组织了一个(gè )少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！