工藤新一是全(quán )国著名的高(gāo )中生侦探(tàn )，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新(xīn )一找到了经(jīng )常(cháng )帮(bāng )助他的阿笠博士，博士(shì )为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为(wéi )了防(fáng )止犯罪团伙对(duì )他进行报复(fù )，新(xīn )一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来(lái )到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落(luò )，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家(jiā )。小兰的父(fù )亲毛利小(xiǎo )五郎(láng )是一名私家(jiā )侦探，新(xīn )一(yī )可以籍着和他一起四(sì )出办案一(yī )起(qǐ )追(zhuī )查(chá )黑夜人的下落。柯南在(zài )小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战！