工(gōng )藤新一是全国(guó )著名的高中生侦(zhēn )探(tàn )，在一次追查(chá )黑衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了(le )小孩！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士(shì )，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得(dé )到解药。一日(rì )，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找男友的下落(luò )，被(bèi )小兰(lán )撞(zhuàng )见的(de )新一情(qíng )急之(zhī )下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是一名私家(jiā )侦(zhēn )探，新一可以(yǐ )籍着和他一起四(sì )出办案一起追查黑(hēi )夜人的(de )下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他(tā )们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！