工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查(chá )黑(hēi )衣人犯(fàn )罪团(tuán )伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神(shén )奇的药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报(bào )复(fù )，新一决(jué )定隐姓(xìng )埋(mái )名，暗中追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下(xià )编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起(qǐ )四(sì )出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认识步美等小(xiǎo )学生(shēng )，他们一起组织(zhī )了(le )一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！