工藤新一是全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕(yūn )后(hòu )喂(wèi )了神奇的药(yào )水，工藤新一(yī )变回了小(xiǎo )孩！新(xīn )一找到了(le )经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯(fàn )罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛(máo )利(lì )兰来到了(le )阿笠博(bó )士的家寻(xún )找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一(yī )起四(sì )出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等小(xiǎo )学生，他(tā )们一起(qǐ )组织(zhī )了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！