工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦(zhēn )探(tàn )，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被(bèi )团伙成(chéng )员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠(lì )博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复(fù )，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿(ā )笠博士的(de )家寻(xún )找男友(yǒu )的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了(le )自己名(míng )叫江(jiāng )户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了(le )小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一(yī )名(míng )私家侦探，新一可以(yǐ )籍(jí )着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下(xià )落(luò )。柯南在小学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣(xuān )战！