工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次追查(chá )黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员发(fā )现，击晕后喂了(le )神奇的(de )药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士(shì )，博士为(wéi )他度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追(zhuī )查(chá )他们，希望(wàng )能(néng )得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着(zhe )和(hé )他一起四(sì )出办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小(xiǎo )学(xué )生(shēng )，他(tā )们(men )一(yī )起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！