工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一(yī )次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后(hòu )喂了神(shén )奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮(bāng )助(zhù )他的(de )阿(ā )笠博士，博士(shì )为(wéi )他度身打(dǎ )造不少间谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查(chá )他们，希(xī )望能得到解(jiě )药。一日，新一(yī ) 的女友毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博士的(de )家寻找男友的(de )下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情(qíng )急之下编造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学(xué )认识步美(měi )等小学生，他们一(yī )起组(zǔ )织了一(yī )个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！