工藤新一是全(quán )国(guó )著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的(de )阿(ā )笠博士，博士为他(tā )度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查(chá )他(tā )们，希望能得到解(jiě )药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的(de )新一情急(jí )之下编造了自(zì )己(jǐ )名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父(fù )亲毛(máo )利(lì )小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美(měi )等小学(xué )生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！