工藤新一(yī )是全国(guó )著(zhe )名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的(de )药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博(bó )士(shì )为他度身打造(zào )不少(shǎo )间谍武器。为了(le )防(fáng )止(zhǐ )犯罪团伙对(duì )他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他(tā )们，希望能得到解药(yào )。一(yī )日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居(jū )在(zài )了小兰家。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以(yǐ )籍(jí )着(zhe )和他一起四出办案一起追查(chá )黑夜人(rén )的下落。柯南(nán )在小学(xué )认识步(bù )美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！