工藤新一(yī )是全国著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人(rén )犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员(yuán )发(fā )现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助(zhù )他的阿(ā )笠(lì )博士(shì )，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得(dé )到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了(le )阿笠(lì )博士(shì )的(de )家寻找男友的下落(luò )，被小兰(lán )撞(zhuàng )见(jiàn )的新(xīn )一情(qíng )急之下编(biān )造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍(jí )着和他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！