工藤新(xīn )一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他(tā )的阿(ā )笠博士(shì )，博士为他度身打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一(yī )情急之下(xià )编造(zào )了自己名叫江户川柯南(nán )，随后(hòu )柯南寄(jì )居在(zài )了小(xiǎo )兰(lán )家。小兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追查(chá )黑夜人的下落。柯南(nán )在小(xiǎo )学认识步美等小学(xué )生(shēng )，他们一(yī )起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！