工藤新一是全国著名的(de )高(gāo )中生侦(zhēn )探，在一次追(zhuī )查(chá )黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士(shì )为他度(dù )身打造不(bú )少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪(zuì )团伙对他进(jìn )行报复(fù )，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找(zhǎo )男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之(zhī )下(xià )编造了(le )自己名叫江(jiāng )户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小(xiǎo )兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等(děng )小学(xué )生，他们(men )一起组织(zhī )了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战！