工藤(téng )新一是全国(guó )著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员发(fā )现(xiàn )，击晕后(hòu )喂了神奇的药水(shuǐ )，工(gōng )藤新一变回(huí )了小孩！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度身打(dǎ )造(zào )不少(shǎo )间谍(dié )武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利(lì )兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友的(de )下落，被小兰撞见(jiàn )的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄(jì )居在了(le )小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学(xué )生，他们一起组织了一个少年(nián )侦探团，向(xiàng )罪犯(fàn )宣战！