工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工(gōng )藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了(le )经常帮(bāng )助他的(de )阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进(jìn )行(háng )报复，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到(dào )了阿笠博士的家寻(xún )找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新一情急之下编(biān )造(zào )了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随(suí )后(hòu )柯南寄居在了(le )小(xiǎo )兰家。小兰的父(fù )亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出办案(àn )一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在(zài )小学认识步美等小学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！