工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯罪团伙对(duì )他进行报(bào )复，新(xīn )一决定隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一(yī )日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男(nán )友的下(xià )落(luò )，被小兰撞见的(de )新(xīn )一(yī )情急之(zhī )下编造(zào )了自己(jǐ )名叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下(xià )落(luò )。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯(fàn )宣(xuān )战！