工藤新一是全(quán )国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂了(le )神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩(hái )！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不(bú )少间(jiān )谍武器(qì )。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行(háng )报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日(rì )，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的(de )家(jiā )寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造(zào )了(le )自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯(kē )南寄居在了小兰家(jiā )。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和(hé )他(tā )一起四出办案一起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美(měi )等小(xiǎo )学生，他们一(yī )起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！