工(gōng )藤新(xīn )一(yī )是全国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇(qí )的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠(lì )博(bó )士，博士(shì )为他度身打(dǎ )造不少间谍武器(qì )。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名(míng )，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一情急之下编造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小(xiǎo )五郎是一名(míng )私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出(chū )办案一(yī )起追查黑夜人(rén )的(de )下落。柯南在小学(xué )认识步美等(děng )小学生(shēng )，他们一起组(zǔ )织了一(yī )个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！