工藤新一是全国著名(míng )的高中(zhōng )生侦探，在(zài )一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤(téng )新一变(biàn )回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度身(shēn )打造不(bú )少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了(le )防(fáng )止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药(yào )。一日，新(xīn )一 的女友毛(máo )利(lì )兰(lán )来到了阿笠(lì )博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编(biān )造了(le )自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是(shì )一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他一起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落(luò )。柯(kē )南在小学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！