工藤新一是全(quán )国著名的高(gāo )中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人(rén )犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员(yuán )发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间(jiān )谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛利兰(lán )来到(dào )了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的(de )新一情急之(zhī )下编(biān )造了自己名叫江户(hù )川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名(míng )私家侦探(tàn )，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识(shí )步美等小(xiǎo )学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣(xuān )战(zhàn )！