工(gōng )藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成(chéng )员发现，击晕(yūn )后喂了(le )神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的(de )阿笠博士，博士(shì )为他度身打(dǎ )造不少(shǎo )间谍(dié )武(wǔ )器。为(wéi )了(le )防止犯(fàn )罪团伙对(duì )他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来(lái )到了(le )阿笠(lì )博士的家寻找男(nán )友的(de )下落，被小兰撞见的(de )新一(yī )情急之下(xià )编造(zào )了(le )自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着和(hé )他一起四(sì )出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学(xué )生，他们一起组织(zhī )了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！