工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙(huǒ )成员发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了神奇的药水(shuǐ )，工藤(téng )新(xīn )一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常(cháng )帮助(zhù )他的(de )阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武(wǔ )器(qì )。为了防止犯(fàn )罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿(ā )笠(lì )博士的(de )家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一(yī )名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一(yī )起四(sì )出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！