工藤新一是全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发(fā )现(xiàn )，击晕后(hòu )喂了神奇的药水(shuǐ )，工藤新(xīn )一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了(le )经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不(bú )少间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙(huǒ )对(duì )他进(jìn )行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的(de )家寻找男(nán )友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲(qīn )毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一(yī )起(qǐ )四出办(bàn )案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！