工藤新一是全(quán )国著名的高中(zhōng )生(shēng )侦探，在一次(cì )追(zhuī )查(chá )黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报(bào )复，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗中追(zhuī )查他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来(lái )到了阿(ā )笠(lì )博(bó )士的家(jiā )寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一(yī )情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰(lán )家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着和(hé )他一起(qǐ )四出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们(men )一起组织了一(yī )个少(shǎo )年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！